MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 plasmid S57

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014629	T	6	6	19	24	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014629	ACA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014629	GAA	2	6	170	175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014629	GAAT	2	8	180	187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014629	AAT	2	6	192	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014629	TCGAT	2	10	230	239	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014629	A	7	7	292	298	100 %	0 %	0 %	0 %	312193365
8	NC_014629	A	6	6	353	358	100 %	0 %	0 %	0 %	312193365
9	NC_014629	TAA	2	6	390	395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193365
10	NC_014629	TGA	2	6	435	440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193365
11	NC_014629	ATT	2	6	476	481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193365
12	NC_014629	CCG	2	6	494	499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193365
13	NC_014629	CAC	2	6	537	542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193365
14	NC_014629	CTT	2	6	578	583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193365
15	NC_014629	AAC	2	6	613	618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193366
16	NC_014629	CAT	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193366
17	NC_014629	TTGTT	2	10	766	775	0 %	80 %	20 %	0 %	312193366
18	NC_014629	T	6	6	774	779	0 %	100 %	0 %	0 %	312193366
19	NC_014629	ACC	2	6	784	789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193366
20	NC_014629	GTTG	2	8	802	809	0 %	50 %	50 %	0 %	312193366
21	NC_014629	CCA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193366
22	NC_014629	GT	3	6	834	839	0 %	50 %	50 %	0 %	312193366
23	NC_014629	TTA	2	6	860	865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193366
24	NC_014629	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014629	TCT	2	6	922	927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193367
26	NC_014629	CGG	2	6	930	935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193367
27	NC_014629	GGA	2	6	943	948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193367
28	NC_014629	TA	3	6	956	961	50 %	50 %	0 %	0 %	312193367
29	NC_014629	TGA	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193367
30	NC_014629	T	6	6	976	981	0 %	100 %	0 %	0 %	312193367
31	NC_014629	TTG	2	6	987	992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193367
32	NC_014629	TAG	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193367
33	NC_014629	TAC	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193367
34	NC_014629	T	6	6	1088	1093	0 %	100 %	0 %	0 %	312193367
35	NC_014629	TAA	2	6	1186	1191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193367
36	NC_014629	CGT	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193367
37	NC_014629	TTG	2	6	1245	1250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193367
38	NC_014629	TTA	2	6	1264	1269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193367
39	NC_014629	TGTT	2	8	1318	1325	0 %	75 %	25 %	0 %	312193367
40	NC_014629	T	6	6	1351	1356	0 %	100 %	0 %	0 %	312193367
41	NC_014629	CCT	2	6	1358	1363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312193367
42	NC_014629	GTT	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193367
43	NC_014629	GTT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193367
44	NC_014629	CTA	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193367
45	NC_014629	TCT	2	6	1462	1467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193367
46	NC_014629	TCA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193367
47	NC_014629	ACTCA	2	10	1553	1562	40 %	20 %	0 %	40 %	312193368
48	NC_014629	ATC	3	9	1572	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193368
49	NC_014629	TTGTGG	2	12	1605	1616	0 %	50 %	50 %	0 %	312193368
50	NC_014629	GC	3	6	1936	1941	0 %	0 %	50 %	50 %	312193368
51	NC_014629	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193368
52	NC_014629	T	8	8	2033	2040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014629	T	7	7	2065	2071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014629	TCC	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014629	T	6	6	2122	2127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014629	TAT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014629	A	6	6	2258	2263	100 %	0 %	0 %	0 %	312193369
58	NC_014629	T	6	6	2264	2269	0 %	100 %	0 %	0 %	312193369
59	NC_014629	AAAG	2	8	2275	2282	75 %	0 %	25 %	0 %	312193369
60	NC_014629	TGA	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193369
61	NC_014629	TCAA	2	8	2388	2395	50 %	25 %	0 %	25 %	312193369
62	NC_014629	TTATT	2	10	2485	2494	20 %	80 %	0 %	0 %	312193369
63	NC_014629	CGCC	2	8	2590	2597	0 %	0 %	25 %	75 %	312193369
64	NC_014629	AGA	2	6	2607	2612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193369
65	NC_014629	ATA	2	6	2623	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193369
66	NC_014629	A	8	8	2658	2665	100 %	0 %	0 %	0 %	312193369
67	NC_014629	TA	3	6	2697	2702	50 %	50 %	0 %	0 %	312193369
68	NC_014629	ATTT	2	8	2811	2818	25 %	75 %	0 %	0 %	312193370
69	NC_014629	TTG	2	6	2875	2880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193370
70	NC_014629	CAA	2	6	2967	2972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193371
71	NC_014629	ATA	2	6	3084	3089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193371
72	NC_014629	CAC	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193371
73	NC_014629	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193371
74	NC_014629	ATTTT	2	10	3192	3201	20 %	80 %	0 %	0 %	312193371
75	NC_014629	TTA	2	6	3264	3269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193371
76	NC_014629	T	6	6	3275	3280	0 %	100 %	0 %	0 %	312193371
77	NC_014629	T	6	6	3473	3478	0 %	100 %	0 %	0 %	312193371
78	NC_014629	CTT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193371
79	NC_014629	T	6	6	3505	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	312193371
80	NC_014629	A	6	6	3538	3543	100 %	0 %	0 %	0 %	312193371
81	NC_014629	TCT	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193371
82	NC_014629	TCT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193371
83	NC_014629	TG	3	6	3712	3717	0 %	50 %	50 %	0 %	312193371
84	NC_014629	GCT	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193371
85	NC_014629	GTG	2	6	3790	3795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193371
86	NC_014629	GAA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193371
87	NC_014629	TTA	3	9	3846	3854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193371
88	NC_014629	GAA	2	6	3867	3872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193371
89	NC_014629	T	6	6	3875	3880	0 %	100 %	0 %	0 %	312193371
90	NC_014629	CTAA	2	8	3888	3895	50 %	25 %	0 %	25 %	312193371
91	NC_014629	T	6	6	3955	3960	0 %	100 %	0 %	0 %	312193372
92	NC_014629	GAT	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193372
93	NC_014629	T	6	6	4036	4041	0 %	100 %	0 %	0 %	312193372
94	NC_014629	TAT	2	6	4093	4098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193372
95	NC_014629	CTAATT	2	12	4235	4246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312193372
96	NC_014629	T	7	7	4250	4256	0 %	100 %	0 %	0 %	312193372
97	NC_014629	CAA	2	6	4281	4286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193372
98	NC_014629	CAT	2	6	4293	4298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193372
99	NC_014629	AAT	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193372
100	NC_014629	T	6	6	4376	4381	0 %	100 %	0 %	0 %	312193372
101	NC_014629	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193372
102	NC_014629	ATATT	2	10	4433	4442	40 %	60 %	0 %	0 %	312193372
103	NC_014629	AGA	2	6	4553	4558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014629	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014629	AGCG	2	8	4876	4883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014629	AG	3	6	5082	5087	50 %	0 %	50 %	0 %	312193374
107	NC_014629	A	6	6	5106	5111	100 %	0 %	0 %	0 %	312193374
108	NC_014629	CAGGAA	2	12	5130	5141	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312193374
109	NC_014629	TAA	2	6	5249	5254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193374
110	NC_014629	GAT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193374
111	NC_014629	AGT	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193374
112	NC_014629	T	6	6	5285	5290	0 %	100 %	0 %	0 %	312193374
113	NC_014629	TGA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193374
114	NC_014629	A	7	7	5308	5314	100 %	0 %	0 %	0 %	312193374
115	NC_014629	TAG	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014629	TATAT	2	10	5510	5519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014629	CCA	2	6	5576	5581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014629	A	7	7	5596	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014629	TAA	2	6	5624	5629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193375
120	NC_014629	ATT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193375
121	NC_014629	ATG	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193375
122	NC_014629	GAT	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193375
123	NC_014629	CGA	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193375
124	NC_014629	AT	3	6	5784	5789	50 %	50 %	0 %	0 %	312193375
125	NC_014629	CAAG	2	8	5792	5799	50 %	0 %	25 %	25 %	312193375
126	NC_014629	GTG	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193375
127	NC_014629	GGA	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193375
128	NC_014629	AAT	2	6	5848	5853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193375
129	NC_014629	TGA	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193375
130	NC_014629	TGA	3	9	5970	5978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193375
131	NC_014629	ATA	2	6	6000	6005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193375
132	NC_014629	CAG	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193376
133	NC_014629	ATA	2	6	6072	6077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193376
134	NC_014629	CAC	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193376
135	NC_014629	CA	3	6	6132	6137	50 %	0 %	0 %	50 %	312193376
136	NC_014629	TAA	2	6	6139	6144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193376
137	NC_014629	CG	3	6	6173	6178	0 %	0 %	50 %	50 %	312193376
138	NC_014629	CGCA	2	8	6284	6291	25 %	0 %	25 %	50 %	312193376
139	NC_014629	AAAC	2	8	6419	6426	75 %	0 %	0 %	25 %	312193377
140	NC_014629	TGT	2	6	6527	6532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193377
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142	NC_014629	A	6	6	6819	6824	100 %	0 %	0 %	0 %	312193377
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253	NC_014629	TAA	2	6	12300	12305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_014629	ATGAT	2	10	12418	12427	40 %	40 %	20 %	0 %	312193390
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259	NC_014629	TTG	2	6	12647	12652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_014629	ATT	2	6	12694	12699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_014629	T	6	6	13204	13209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014629	GT	3	6	13210	13215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014629	TTTA	2	8	13224	13231	25 %	75 %	0 %	0 %	312193394
273	NC_014629	ACAT	2	8	13233	13240	50 %	25 %	0 %	25 %	312193394
274	NC_014629	TTGA	2	8	13282	13289	25 %	50 %	25 %	0 %	312193394
275	NC_014629	ACG	2	6	13330	13335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193394
276	NC_014629	T	6	6	13357	13362	0 %	100 %	0 %	0 %	312193394
277	NC_014629	CGG	2	6	13390	13395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193394
278	NC_014629	CGC	2	6	13414	13419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193394
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394	NC_014629	TTGC	2	8	18969	18976	0 %	50 %	25 %	25 %	312193400
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396	NC_014629	T	6	6	18998	19003	0 %	100 %	0 %	0 %	312193400
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401	NC_014629	ATA	2	6	19163	19168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193400
402	NC_014629	AT	3	6	19185	19190	50 %	50 %	0 %	0 %	312193400
403	NC_014629	TGA	2	6	19195	19200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193400
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405	NC_014629	T	6	6	19474	19479	0 %	100 %	0 %	0 %	312193400
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